Hola gracias por la respuesta pero ya lo probé y el problema es que le cupón se aplica a todos los productos cuando vas a hacer la compra.
Lo he preguntado en el foro de joomshopping y me han dicho que pruebe usando precio antiguo y nuevo. La sensación que tengo es que no se puede aplicar un descuento directamente y creo que es un atraso. En mi caso hemos dicho que la gente que haga el pedido a través de la web en productos de una marca recibirá un 3% de descuento y creo que no lo vamos a poder hacer de ese modo.