Hola Teleco,mira como te he dicho cada Template es un mundo.
Aqui un ejemplo del template rhuk_milkyway que viene por defecto en Joomla!.
Abres el archivo template.css y en la linea 82 comienza el código del logo.
div#logo {
position: absolute;
left: 0;
top: 0;
float: left;
width: 298px;
height: 75px;
background: url(../images/mw_joomla_logo.png) 0 0 no-repeat;
margin-left: 30px;
margin-top: 25px;