Si desintalas Community builder los usuarios no se van a borrar ya que la gestion principal de los usuarios se realiza desde joomla. Para pasar tus usuarios de CB a Jomsocial hay una extension para realizar la migracion, te lo puedes descargar desde el post desde el cual ya se trato la cuestion –> http://solojoomla.com/foro/componentes/migrar-de-community-builder-a-jomsocial.html .
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