No te quiero desanimar pero lo que pides es complicado.
Un programa como el que necesitas tendría que ser en PHP u otro lenguaje de alto nivel.
En el primer caso se podría usar la base de datos de Joomla si lo quieres tener on line en la misma BD, integrarlo con Joomla ya es otra historia bastante más complicada. De los que yo conozco hay dos que tal vez puedan servir para una posible adaptación, uno es SimpleInvoice y el otro PHPCoin. Esto sería cambiando bastante código y por cierto, un trabajo nada sencillo.
Para el caso de un programa de alto nivel, soy programador Powerbuilder y Visual FoxPro y te digo que es un trabajo también de unas cuantas semanas, dependiendo del grado de complejidad al que apuntes.
Saltando los anteriores y pensando solamente en una simple aplicación en Acces, el trabajo podría ser mas simple. Es más, se podría usar una aplicación que ya hay en Acces y agregarle lo que necesites.
Resumiendo: tendrías que especificar más a fondo la cuestión para hacer una evaluación más concreta.