Si, yo mismo he redactado mi opinion en algunas webs sobre ese tema y en este foro, y en tu caso si es recomendable que utilizes joomla 1.6, simplemente porque te es necesario y antes o depsues joomla 1.6 se impondra, solo es cuestion de que los usuarios se vayan acostumbrando y sobre todo que los desarrolladores actualizen sus extensiones, actualmente solo el 7% de las extensiones que hay en el JED sirven para joomla 1.6.
Mi opinion > http://solojoomla.com/foro/joomla-en-general/joomla1.6.0-estable.html , leete todo el post.