bueno mi amigo que te puedo decir.
como hiciste una nueva instalacion y le diste el nombre de la base de datos que tenias anteriormente, ahora todos tus archivos ya fueron, se reescribieron todas las tablas(menos la de los modulos y de los componentes), eso quiere decir que se borro los datos anteriores y se pusieron los que vienen por defecto cuando instalas joomla.
Es una pena, por eso es bueno siempre hacer una copia de seguridad.
saludos