hola! es porque la versión del servidor es superior a 5.0, tiene que cambiar TYPE=MyISAM por ENGINE=MyISAM en la carpeta instalacion, te explico!! va al installationsqlmysql y dentro abres joomla sql y todo lo que tenga TYPE=MyISAM lo cambias por ENGINE=MyISAM , si este es el problema cuando tengas que instalar componentes tendrás que hacer algo parecido con cada cosa!! adjunto como quedaria!
! suerte!!