No, es la estructura de los enlaces de los artículos, es muy limpia como con WordPress, pero, además siguen estando publicados en portada y bajo otras categorias.
Lo decia porque yo la unica manera de conseguir URLS tan limpias en mi sitio, era creando desde un menu un link a un artículo y te ponia de ejemplo este:
http://www.solojoomla.com/utilizar-el-archivo-.htaccess-en-joomla.html