Gracias Redlo, finalmente logré solucionarlo, el firebug la verdad no lo conocia es muy eficiente, aunque batallé un buen ya que esta plantilla es muy compleja, los estilos para corregir lo de las mayusculas no estan donde pensaba (en las carpetas del template), el estilo lo encontré en la carpeta del caché de joomla, el firebug me indicaba que estaba en dicha carpeta justo en el archivo css.php y si ahi estaba solamente que no modifique ese archivo si no otro con un nombre muy raro de numeros y letras con extension .css y ahi estaba la etiqueta #system.title que al modificarla asunto arreglado.