No entiendo que quieres decir. ¿Cuantos menus tienes? ¿Cual es enlace de Inicio (predeterminado) y en que menu esta?.
Algunos enlaces para saber algo más::
Como posicionar mis modulos en Joomla 2.5
Como crear un enlace de menú, para mostrar un componente joomla!
Estos dos enlaces te orientaran algo mejor, incluso quizas resuelvas tu problema, que parece mas bien debido a falta de información.
Saludos