Yo miraria las ultimas extensiones instaladas o alguna copia que tengas por ahi, por si han entrado en tu web y te estan haciendo la puñeta.
Verifica que desde por ejemplo Google, los enlaces que van a tu web, efectivamente es asi y no se direcciona a otras. Es facil que pueda pasar, mas se instalan extensiones joomla desde fuentes no originales. OjO con eso, que mas de uno ha caido.
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