Dime que es lo que quieres personalizar exactamente. Porque para virtuemart 3, si hablamos de campos personalizados y variantes del producto, se ha mejorado la posibilidad de personalizarlo.
La personalización en general, para virtuemart 3, de aspecto y estilo, se realiza desde tu plantilla, con la técnica Template overrides.
Enlaces Virtuemart:
http://docs.virtuemart.net/tutorials/development/175-code-adjustments-for-virtuemart-3.html
Tambien existen extensiones especificas que te facilitan esa labor. Como Custom Fields for ALL.
Captura y DEMO
Otros como Virtuemart textarea custom field , gratuito.