Desde Joomla! no se puede y desconozco si existe una extensión a tal efecto, pero lo que si puedes hacer es un componente que obtenga y el xml que contenga un directorio volcarlo en un textarea donde poder hacer los cambios y guardar el resultado reecribiendolo. Pero casi que es más facil abrirlo con un editor normal y editar el contenido para subirlo por ftp, ademas de la forma que tu lo imaginas primero necesitas una vista con la lista de xml de todo el arbol de directorios y marcando el checkbox abrir la segunda vista de edición.
No es que sea muy muy complejo pero como digo casi es mas fácil editar a mano desde nuestro editor.