Tenes que poner el Notepad++ y en Formato elegir codificar UTF-8 sin bom.
Luego todo lo que corrijas allí se grabará con ese formato.
Si lo habres con el mismo Notepad no notaras la diferencia puesto que el programa reconoce el formato y automáticamente lo selecciona, es decir lo verás normal, con acentos, eñes y todo.