La verdad esque estoy trabajando en Local y con Joomla 1.5.9
Pero bueno gracias por el intento de ayuda, de todas formas miraré a ver eso que as comentado de las base de datos aunque creo que por hay no va el fallo.
Es en plan que donde carga los metadatos del index carga el UTF-8, y eso es lo que me gustaria modificar.