Hola
Revisaste los archivos de configuración de tus sitios?
Subiste tu base de daots editada?
Revisa bien esas dos cositas y veras que te funciona.
No puede ser otra cosa hermano.
NOTA: Si lo deseas pasame los archivos de configuración de ambas web, y la base de datos de cada una para revisarlas, lo otro sería ver tus base de datos en linea y los servidores a ver como está todo eso. Eso claro es si tu quieres. Otra cosa, tu sitio usa CPanel?