Cuando instalas jomsocial, efectivamente en la parte superior del administrador de joomla muestra un enlace de actualizacion. El archivo que seguramente te falta se situa en la carpeta /tmp de la raiz de tu joomla, al menos para versiones 2.0 el archivo se llama jomsocialupdate.ini. Quizas tengas la carpeta /tmp con alguna opcion de borrado automatico o algo por el estilo.
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