Hola:
Si te entiendo bien lo que esta sucediendo es que el modulo del menu principal esta configurado para que aparezca solo en la pagina de inicio o frontend.
Haz esto:
Extensiones –>gestor de modulos –>click en menu principal y verifica que en el item “asignacion de menu”–> “menus” este el punto en “todo”.
Incluyo una captura
Espero sea util.
Saludos
Max 
