Las columnas Left y Right estan ocupadas por modulos, no tienes que tocar el codigo para nada. Vas a la gestion de los modulos, te fijas en los que te aparecen a ambos lados y pinchas en el primero, el que peor te caiga 🙂 y accedes al modulo, en el apartado "Asignacion de menu" veras como te aparece el wrapper que has insertado, seleccionas "Selecciona item(s) del menu " se activaran las opciones a seleccionar y con la tecla CTRL, seleccionas donde quieres que aparezca y donde NO quieres que aparezca ese modulo, simplemente no lo seleccionas. Asi sucesivamente con todos los modulos que te estorben en alguna posicion. Es asi de sencillo.
Joomla contempla todas esas opciones, y esta es una de las razones por la cual es diferente a los demas, ni mejor ni peor, solo diferente y muy sencillo de gestionar. Antes de hacer nada, piensa en la solucion mas sencilla, seguramente la encontraras sin hacer ningun cambio en el codigo.
Imagino que eres programador y estas habituado a un retoque por aqui, otro por alla… Aqui te servira, si pero para crear tus propias extensiones.
Dime como te a ido.