Gracias por contestar. Si, eso tambien esta borrado ya que antes de ponerme a eliminar las tablas voy a _extensions y elimino el componente de VM.
La cuestion es que me crea las tablas y todo pero no me sube las carpetas al servidor, he revisado en administrator-components y no esta la carpeta com_virtuemart. Ahora mismo acabo de instalarlo otra vez y estoy subiendo los archivos manualmente a ver que pasa. Descarto un error de permisos?