Pueden ser muchos los motivos para que esto suceda. Debes hacer memoria de que fue lo ultimo que instalaste o activaste, como por ejemplo alguna extension para url´s amigables, si tenias una extension en la pagina de inicio y la has desinstalado. Si a ocurrido sin mas, revisa que tienes todos los archivos y carpetas en su sitio desde tu cliente FTP, es posible tambien que algun archivo fue cambiado de permisos, problemas con tu hosting si trabajas desde uno, asi un largo etcetera.
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