como buscando y buscando en varios luhares, me di cuenta que es facil con el mismo modulo que tengo que es este mod_flashmod , ya que tiene las opciones de Window mode, que tiene las siguientes opciones
*Window
*Opaque
*Transparent
, cuando se instala el modulo por default aparece como Window, pero para solucionar el problema, basta con seleccionas el modo opaco ó transparente, esta solucion es para que los submenus aparezcan frente al banner, bueno espero les sirva la ayuda