bueno por un lado me alegro que se haya instalado bien y que haya dejado de tirar esos errores
por otro lado.. si estas trabajando en una web estable… te recomiendo que instales el componente akeeba backups…
realzia backups seguido + backups de tu base de datos desde phpmyadmin
digo esto con el fin de prevenir, y en caso de que no hayas podido prevenir tendrás fácil recuperación.
Todo esto de backups te lo digo con el fin de que intentes actualizar el virtuemart luego de hacer un backup completo.
Espero que actualice el componente sin convenientes … exitos amigo!