Lee este tutorial http://solojoomla.com/hagamos-de-nuestro-joomla-un-sistema-mas-seguro.html y aplicalo a tu web, te dejo el codigo del archivo configuration.php, lo copias en el tuyo, para que solo le cambies las rutas absolutas, y renombra la carpeta installation de la raiz de tu joomla.
Lineas que debes cambiar
var $log_path = 'W:/var/www/CARPETA/log';
var $tmp_path = 'W:/var/www/CARPETA/tmp';
...............
var $user = 'USUARIO';
var $db = 'NOMBRE_BASE_DATOS';
...............
var $mailfrom = 'TU@EMAIL.com';