Ese archivo puede contener el código que hace que tengas ese problema, pero no es seguro. Hay pasos que seguir cuando te hackean la web.
Primero descargate todos los archivos en tu ordenador y pasale un antivirus.
Luego busca archivos con nombres que no te suenen que sean de joomla. Eso lo puedes comprobar descargandote un pack joomla y comprar.
Y ya que te has descargado un pack limpio, compara el peso de los archivos. Los infectados suelen pesar bastante mas.
Pero yo te digo una cosa… Vi tu web en su día y comentaste que estaba creada con artisteer, y no se si alguien te lo llego a comentar, pero artisteer, te llena la pagina / plantilla de scripts, y eso no es bueno.
¿Que haria yo?
Me haria una copia de los contenidos de tu web desde phpmyadmin, con DROP TABLE para sobre escribir las tablas de tu nueva web. Y hablando de nueva web, me pondria con un framework que sea sencillo de configurar y me crearia una web nueva SIN artisteer, teniendo a buen recuado todos mis contenidos que lo mas seguro esten limpios, aprovechariua la ocasión para empezar de cero haciendo las cosas bien desde ese momento y por supuesto… en cuanto tuviera la web mas o menos en condiciones… COPIA de SEGURIDAD.