Si, y depende de que modulo estes utilizando para el slide. El que suele dar problemas en ese aspecto es el Vinaroa Nivo Slider . Este tema se solventa desde el archivo template.css de la plantilla, aunque seguramente hayas instalado un QuickStart, a lo que llamas template, es tambien el Framework Helix de Joomshaper en su version 2 que incluye la plantilla y que incluye tambien, en la instalación rápida (Quickstart) , el Modulo SP Smart Slider, colocado justo debajo del menu y que al desplegar el submenu, se esconde detras del modulo.
Ese modulo incluye un estilo llamado Nivo Slider, que sera el que estes utilizando y que precisamente da ese problema que comentas.
SOLUCIONES:
Buscar otro modulo slide que no te de ese problema,
Cambiar el estilo del propio modulo a otro de los tantos de los que dispone el modulo y que no te va a dar ese problema.
O bien, accede al archivo de tu plantilla en la carpeta /css y edita el archivo template.css.
Sobre la linea 998 aproximadamente (se dice aproximadamente porque desconozco que editor vas a utilizar y puede cambiar el numero segun que editor) esta el siguiente código
[code type=css].sp-submenu {
position: absolute;
top: 0;
visibility: hidden;
opacity: 0;
z-index: 0;
margin-top: 30px;
-webkit-transition: margin 100ms, visibility 100ms, opacity 100ms;
-moz-transition: margin 100ms, visibility 100ms, opacity 100ms;
-o-transition: margin 100ms, visibility 100ms, opacity 100ms;
transition: margin 100ms, visibility 100ms, opacity 100ms;
}[/code]
Tienes que cambiar z-index: 0; por z-index: 9999; lo que permitira al submenu pasar por encima del modulo. Deberia funcionar. Cuenta como te fue.