Mira ver si tienes la carpeta com_jshopping en /templates/TU_PLANTILLA/html y cambiale el nombre añadiendo una letra o numero a la carpeta para desactivarla. Quizas sea ese el problema.
Dependiendo del framework template que este utilizando, puede incluir un overrides, y si el overrides es anterior a la versión de tu joomshopping, puede influir en este tipo de cosas.