Pues ya tenia instalado el joomdle pero lo del archivo no lo sabia. Voy a empezar de cero, instalando un nuevo joomla con un moodle 2 en una carpeta del dominio y en cuanto lo tenga seguimos.
Prefiero empezar de cero porque me da que he cometido muchos errores y prefiero empezar de cero siguiendo el orden de las instrucciones que me has dado.
Aviso cuando lo tenga.