Hola el chmod del index.php no es 775, que les estas permitiendo meterse. El CHMOD de los archivos de joomla, WordPress etc… es 644. El del archivo configuration.php una vez realizados los ajustes de un joomla se pone a 444.
Prueba a ver, pero parece que hay algo mas. Prueba y dime.
NOTA: Los permisos de archivos y carpetas CHMOD son otorgados por el servidor, siempre que sea un LINUX.
Saludos